История естественно-географического факультета начиналась в 1963 году с открытия на дневном отделении агробиологического факультета и приема 25 студентов. В 1966 году был осуществлен первый выпуск на заочном, а в 1968 году - на дневном отделениях. В 1970-71 учебном году на стационарном отделении введен новый учебный план, согласно которому факультет приступил к подготовке учителей биологии с дополнительной специальностью химия (декан – доцент Альфред Петрович Харью). Учебный план пополнился такими дисциплинами как математика и физика, которые раньше на биологических факультетах не изучались, значительна быдла изменена структура изучения психолого-педагогических дисциплин.
Первым деканом агробиологического является Светлана Суруновна Курбатская, которая руководила факультетом с 1963 по 1968 годы. Светлана Суруновна – умелый организатор, которая на своих плечах вынесла основную тяжесть работы по организации учебного процесса в новом подразделении и создания материальной базы факультета.
С 1963 до 1972 года факультетом руководил Альфред Петрович Харью. Он внес достойную лепту в дело развития тогда уже биолого-химического факультета.
С 1972-по 1976 год факультетом руководил Георгий Васильевич Николаев. Он своим творческим трудом внес заметный вклад в организацию и совершенствование учебно-воспитательного процесса.
В 1976-1982 годах факультет возглавлял Раиса Федосеевна Петрова. В эти годы особое внимание уделяется научному содержанию лекций, качеству семинаров и практических занятий. Именно в этот период (1982 год) открываются новые специальности, вследствие чего факультет был переименованв естественно-географический факультет.
С мая 1983 год по 1987 год деканом работала Дарый Биче-ооловна Баранова. При ней кафедры факультета значительно расширяют связи со школами и другими учреждениями народного образования. Повсеместно традиционными становятся тематические вечера по биологии, химии, географии.
С приходом в 1987 году молодого и энергичного декана Николая Григорьевича Дубровского на факультете увеличивается перечень новых направлений подготовки. Появляются такие специальности как «биология-физкультура», «география-история», «биология-сельско-хозяйственный труд», «биология-экология», «химия-обслуживающий труд». Совершенствуется учебный процесс, на кафедрах создается обстановка, способствующая хорошим отношениям между сотрудниками и не препятствующая их творческой деятельности. В 1999 году Николай Григорьевич уходит на повышение, став ректором, и руководит университетом на протяжении восьми лет.
С 1999 по 2010 год факультетом руководила доцент Ирина Викторовна Бурхинова. Упор в последние годы делается на самостоятельную работу студентов. Активизируется работа студенческого самоуправления. Открываются новые специальности, такие как валеология, экология, безопасность жизнедеятельности, химия-безопасность жизнедеятельности, география-биология, география-безопасность жизнедеятельности.
С сентября 2010 года по настоящее время факультетом руководит профессор, доктор биологических наук Николай Григорьевич Дубровский.
Гордостью факультета коллеги называют преподавателей Лилию Кыргысовну Аракчаа, Серин Кыргысовну Чоксум, Долуму Дмитриевну Сарбаа, Светлану Суруновну Курбатскую работающих на факультете с первых дней его образования. Своей преданностью работе и энтузиазмом они показывают пример работающим на факультете молодым специалистам.
В настоящее время штат ЕГФ состоит из 75 сотрудников. Из них 52 преподавателя, среди которых 11 профессоров, 35 преподавателя имеют ученые степени кандидатов и докторов наук. Ежегодно факультет принимает около 100 студентов, и в настоящее время там обучается в общей сложности 422 будущих учителей биологии, биологии-химии, химии-безопасности жизнедеятельности, географии, географии-безопасности жизнедеятельности. На факультете работает 6 кафедр: общей биологии, экологии и зоологии, химии, анатомии, физиологии и безопасности жизнедеятельности, физической географии и геоэкологии, экономической географии и геоинформационных систем, имеется четыре учебно-научных лаборатории: экологии, гербарий, генетики и микробиологии, ландшафты и ГИС. Открыта аспирантура по специальностям «экология» и «геоэкология».
